Les travaux de cette équipe concernent l'écologie, la dynamique et la biologie de la conservation des poissons migrateurs amphihalins dans les fleuves et les estuaires européens. Ces espèces ont la particularité d'utiliser à la fois les eaux douces et les eaux marines pour accomplir leur cycle vital. On en dénombre une quinzaine d'espèces en Europe de l'Ouest parmi lesquelles on distingue celles qui se reproduisent en mer (espèces thalassotoques) et grandissent en rivière comme par exemple l'anguille européenne et celles qui se reproduisent en rivière (espèces potamotoques) et grandissent en mer comme par exemple les aloses, les lamproies, les esturgeons ou le saumon atlantique.

Ces espèces sont le support d'activités de pêche parfois localement importantes au point de vue économique et culturel que ce soit par des pêcheurs commerciaux (anguille en France, éperlan aux Pays-Bas) où des pêcheurs de loisirs (saumon). Actuellement la plupart de ces espèces sont menacées par la raréfaction des habitats accessibles et des prélèvements par pêche trop importants.

Nos travaux de recherche se concentrent sur quelques thématiques socialement importantes pour lesquelles les poissons migrateurs sont des modèles de choix.

Les processus d'utilisation de l'espace par les poissons migrateurs constituent une de leur spécificité. Il s'agit pour nous de préciser la façon dont ces espèces utilisent successivement au cours de leur vie des habitats essentiels situés dans des compartiments de salinité différente. A différentes échelles il s'agit donc de caractériser ces habitats et ces migrations. Les interactions entre les migrations et les processus de croissance, de maturation/reproduction et de mortalité constituent également un aspect important de nos travaux. Ces approches centrées sur les processus sont agrégées de façon plus globale grâce à des approches de modélisation permettant de dégager les grandes caractéristiques fonctionnelles de ces populations ou de ces espèces et de tester des scénarios (aménagements, changements climatiques). Des travaux sont également réalisés à l'échelle des assemblages de poissons migrateurs.

Dans le cas des espèces ou des populations les plus menacées, nous développons une ingénierie écologique adaptée à la restauration de ces populations par soutien de population ou par réintroduction". Ce volet qui peut faire appel à des actions de conservation ex situ (poissons conservés en captivité) est développé en accompagnement d'actions de conservation comme celle de l'esturgeon européen, ou la réintroduction de grande alose dans le bassin Rhénan.

Enfin sur la base de notre connaissance de l'écologie des espèces et de la gestion des espèces migratrices nous développons des outils d'aide à la décision pour la gestion durable de ces espèces. Ceci fait appel à des outils de simulation et à des partenariats avec des laboratoires d'économie, de sociologie ou d'anthropologie.

La restauration de la continuité écologique des cours d'eau à poissons migrateurs se situe dans ces thématiques prioritaires et est mise en œuvre par l'équipe GHAAPPE.

Cette équipe s'inscrit dans le réseau DIADFISH de laboratoires européens travaillant sur les poissons migrateurs et est responsable d'un module d'enseignement sur ces thématiques dans le cadre du Master Systèmes écologiques de l'université de Bordeaux.